木棉花具有调理肠胃的功效，木棉花能治疗肠胃功能失调，对慢性胃炎、腹胀、腹泻都有很好的效果。木棉也具有清热解毒作用，它的花、皮、根都能够食用、可以解毒祛湿、清热利尿，木棉花晒干后泡水喝可以生津解渴，清热解毒。中药木棉花可以用于治疗腰腿酸痛，关节炎等病症，具有非常好的疗效。
由于木棉花偏寒，因此体质弱、肠胃不好、经常拉肚子的人慎食木棉花，以免出现一些不良反应。
木棉的树皮味苦，性平，功能祛风湿，通经络，杀虫。治风湿痹痛，痢疾，牙痛，疥癣。1、《海药本草》：主腰脚不遂，顽痹腿膝疼痛，霍乱，赤白泻痢，血痢，疥癣。2、《日华子本草》：治血脉麻痹疼痛，及煎洗目赤。3、《纲目》：能行经络，达病所，又入血分及去风杀虫。4、《岭南采药录》：生肌，止痛，散血，凉皮肤，敷跌打。5、《南宁市药物志》：消肿，散瘀，止痛。疗咳嗽，止产后瘀血作痛。6、《贵州草药》：解热祛瘀，解毒生肌。治乳痈，骨折。7、《开宝本草》：主霍乱中恶，赤白久痢，除甘匿、疥癣。牙齿虫痛，并煮服及含之，水浸洗目，除肤赤。
可将木棉花做鲫鱼汤，能起到健脾养胃，清热利湿，凉血止血的功效。
木棉除了观赏价值高，它的花、皮、根均有药用价值。将晒干了的木棉花煮粥或者煲汤，可以解毒清热驱寒去湿；木棉皮煮水也有清热、利尿、解毒等功效，对慢性胃炎、胃溃疡、泄泻、痢疾等有显著疗效。另外，木棉的用途也很广，它的花蕊是很好的织物材料。而木棉的木质松软，可制作包装箱板、火柴梗、木舟、桶盆等，还是造纸的原料。
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